MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 39984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020247	AG	3	6	200	205	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
2	NC_020247	AG	3	6	215	220	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
3	NC_020247	ACCGGA	2	12	287	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068324
4	NC_020247	AGG	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068324
5	NC_020247	AAG	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068324
6	NC_020247	AGGT	2	8	399	406	25 %	25 %	50 %	0 %	449068324
7	NC_020247	GAG	2	6	455	460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068324
8	NC_020247	AGAA	2	8	496	503	75 %	0 %	25 %	0 %	449068324
9	NC_020247	TAG	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068324
10	NC_020247	AT	3	6	536	541	50 %	50 %	0 %	0 %	449068324
11	NC_020247	ACT	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068324
12	NC_020247	GTAA	2	8	635	642	50 %	25 %	25 %	0 %	449068324
13	NC_020247	ATG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068324
14	NC_020247	ATTA	2	8	766	773	50 %	50 %	0 %	0 %	449068324
15	NC_020247	AT	3	6	802	807	50 %	50 %	0 %	0 %	449068324
16	NC_020247	TGC	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068324
17	NC_020247	GCT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068324
18	NC_020247	GGAA	2	8	889	896	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
19	NC_020247	ATA	2	6	926	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068324
20	NC_020247	AG	3	6	943	948	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
21	NC_020247	AGCT	2	8	987	994	25 %	25 %	25 %	25 %	449068324
22	NC_020247	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068324
23	NC_020247	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068324
24	NC_020247	ATA	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068324
25	NC_020247	AAGGG	2	10	1154	1163	40 %	0 %	60 %	0 %	449068324
26	NC_020247	GGA	2	6	1166	1171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068324
27	NC_020247	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068325
28	NC_020247	GAG	3	9	1326	1334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068325
29	NC_020247	TAT	3	9	1426	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068325
30	NC_020247	AGTA	2	8	1465	1472	50 %	25 %	25 %	0 %	449068325
31	NC_020247	AGA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068325
32	NC_020247	AATAG	2	10	1561	1570	60 %	20 %	20 %	0 %	449068325
33	NC_020247	TAG	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068325
34	NC_020247	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068326
35	NC_020247	AAT	2	6	1766	1771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
36	NC_020247	AT	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
37	NC_020247	TAG	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068326
38	NC_020247	AGT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068326
39	NC_020247	ATA	3	9	1914	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
40	NC_020247	AT	3	6	1973	1978	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
41	NC_020247	TTAC	2	8	2025	2032	25 %	50 %	0 %	25 %	449068326
42	NC_020247	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068326
43	NC_020247	TAA	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
44	NC_020247	TGC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068326
45	NC_020247	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068326
46	NC_020247	AT	3	6	2309	2314	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
47	NC_020247	TAA	2	6	2371	2376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
48	NC_020247	TTA	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068326
49	NC_020247	AT	3	6	2463	2468	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
50	NC_020247	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068326
51	NC_020247	AAAG	2	8	2559	2566	75 %	0 %	25 %	0 %	449068327
52	NC_020247	T	6	6	2570	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	449068327
53	NC_020247	TTTA	2	8	2625	2632	25 %	75 %	0 %	0 %	449068327
54	NC_020247	CTTCCT	2	12	2708	2719	0 %	50 %	0 %	50 %	449068327
55	NC_020247	TTA	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068327
56	NC_020247	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068327
57	NC_020247	CTCTTG	2	12	2831	2842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	449068327
58	NC_020247	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068327
59	NC_020247	A	6	6	2878	2883	100 %	0 %	0 %	0 %	449068327
60	NC_020247	TTA	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068327
61	NC_020247	ATA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068327
62	NC_020247	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	449068327
63	NC_020247	TAG	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068328
64	NC_020247	AAT	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068329
65	NC_020247	CT	3	6	3982	3987	0 %	50 %	0 %	50 %	449068329
66	NC_020247	TCC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068329
67	NC_020247	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068330
68	NC_020247	AG	3	6	4345	4350	50 %	0 %	50 %	0 %	449068330
69	NC_020247	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068330
70	NC_020247	AT	3	6	4426	4431	50 %	50 %	0 %	0 %	449068330
71	NC_020247	CTAA	2	8	4442	4449	50 %	25 %	0 %	25 %	449068330
72	NC_020247	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	449068330
73	NC_020247	ACT	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068331
74	NC_020247	TCT	2	6	4562	4567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
75	NC_020247	AAT	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068331
76	NC_020247	TCC	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068331
77	NC_020247	CTAC	2	8	4649	4656	25 %	25 %	0 %	50 %	449068331
78	NC_020247	AGTG	2	8	4691	4698	25 %	25 %	50 %	0 %	449068331
79	NC_020247	TCT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
80	NC_020247	TCT	2	6	4921	4926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
81	NC_020247	TTC	2	6	4927	4932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
82	NC_020247	CTT	2	6	5028	5033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
83	NC_020247	CTA	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068331
84	NC_020247	TA	3	6	5103	5108	50 %	50 %	0 %	0 %	449068331
85	NC_020247	GTA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068331
86	NC_020247	GA	3	6	5348	5353	50 %	0 %	50 %	0 %	449068332
87	NC_020247	CTC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068332
88	NC_020247	GAGG	2	8	5524	5531	25 %	0 %	75 %	0 %	449068332
89	NC_020247	CTT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068332
90	NC_020247	TA	3	6	5591	5596	50 %	50 %	0 %	0 %	449068332
91	NC_020247	AGT	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068332
92	NC_020247	CTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068332
93	NC_020247	AAT	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068332
94	NC_020247	TCT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068332
95	NC_020247	TGA	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068332
96	NC_020247	CAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068332
97	NC_020247	CTAA	2	8	6304	6311	50 %	25 %	0 %	25 %	449068333
98	NC_020247	ATT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068333
99	NC_020247	TGG	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068333
100	NC_020247	ATG	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068333
101	NC_020247	ATA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
102	NC_020247	T	7	7	6494	6500	0 %	100 %	0 %	0 %	449068333
103	NC_020247	TTG	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068333
104	NC_020247	TCC	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068333
105	NC_020247	GAT	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068333
106	NC_020247	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
107	NC_020247	AAT	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
108	NC_020247	CTA	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068333
109	NC_020247	GAA	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068333
110	NC_020247	TTA	2	6	6803	6808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068333
111	NC_020247	ATG	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068333
112	NC_020247	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
113	NC_020247	AAGC	2	8	6956	6963	50 %	0 %	25 %	25 %	449068333
114	NC_020247	GGCTAA	2	12	6987	6998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449068333
115	NC_020247	TCC	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068333
116	NC_020247	TTC	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068333
117	NC_020247	GGT	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068333
118	NC_020247	TA	4	8	7104	7111	50 %	50 %	0 %	0 %	449068333
119	NC_020247	AGA	2	6	7246	7251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068333
120	NC_020247	GGA	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068333
121	NC_020247	GTTG	2	8	7327	7334	0 %	50 %	50 %	0 %	449068333
122	NC_020247	GTT	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068333
123	NC_020247	GA	3	6	7444	7449	50 %	0 %	50 %	0 %	449068333
124	NC_020247	AAT	2	6	7476	7481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
125	NC_020247	ATC	2	6	7491	7496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068333
126	NC_020247	TC	3	6	7500	7505	0 %	50 %	0 %	50 %	449068333
127	NC_020247	AT	3	6	7536	7541	50 %	50 %	0 %	0 %	449068333
128	NC_020247	TAT	4	12	7545	7556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068333
129	NC_020247	AGA	2	6	7568	7573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068333
130	NC_020247	TA	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	449068334
131	NC_020247	CAT	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068334
132	NC_020247	AAC	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068334
133	NC_020247	TATTT	2	10	7874	7883	20 %	80 %	0 %	0 %	449068334
134	NC_020247	TCAA	2	8	7932	7939	50 %	25 %	0 %	25 %	449068334
135	NC_020247	GAT	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068334
136	NC_020247	TTC	2	6	7964	7969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068334
137	NC_020247	TCT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068334
138	NC_020247	ATA	2	6	8006	8011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068334
139	NC_020247	CAAGC	2	10	8050	8059	40 %	0 %	20 %	40 %	449068334
140	NC_020247	TTTTAA	2	12	8080	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068334
141	NC_020247	TAT	2	6	8104	8109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068334
142	NC_020247	TTC	2	6	8151	8156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068334
143	NC_020247	TAA	2	6	8408	8413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068335
144	NC_020247	TGG	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068335
145	NC_020247	CT	3	6	8429	8434	0 %	50 %	0 %	50 %	449068335
146	NC_020247	AAG	2	6	8441	8446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068335
147	NC_020247	AT	3	6	8449	8454	50 %	50 %	0 %	0 %	449068335
148	NC_020247	ATAGA	2	10	8458	8467	60 %	20 %	20 %	0 %	449068335
149	NC_020247	GTA	2	6	8482	8487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068335
150	NC_020247	TTG	2	6	8497	8502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068335
151	NC_020247	ATTT	2	8	8513	8520	25 %	75 %	0 %	0 %	449068335
152	NC_020247	CTAAA	2	10	8572	8581	60 %	20 %	0 %	20 %	449068335
153	NC_020247	TTC	2	6	8603	8608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068335
154	NC_020247	TGG	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068335
155	NC_020247	A	6	6	8745	8750	100 %	0 %	0 %	0 %	449068335
156	NC_020247	TAC	2	6	8767	8772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068335
157	NC_020247	GAA	2	6	8778	8783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068335
158	NC_020247	TC	3	6	8915	8920	0 %	50 %	0 %	50 %	449068335
159	NC_020247	AGGCAA	2	12	8953	8964	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449068335
160	NC_020247	GTT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068335
161	NC_020247	GA	3	6	9001	9006	50 %	0 %	50 %	0 %	449068335
162	NC_020247	TCA	2	6	9098	9103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068336
163	NC_020247	CTC	2	6	9136	9141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068336
164	NC_020247	AGT	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068336
165	NC_020247	TA	4	8	9175	9182	50 %	50 %	0 %	0 %	449068336
166	NC_020247	AAT	2	6	9236	9241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068336
167	NC_020247	TCC	2	6	9263	9268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068336
168	NC_020247	CT	3	6	9274	9279	0 %	50 %	0 %	50 %	449068336
169	NC_020247	CAG	2	6	9321	9326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068336
170	NC_020247	CT	3	6	9383	9388	0 %	50 %	0 %	50 %	449068336
171	NC_020247	ACT	2	6	9410	9415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068336
172	NC_020247	AT	3	6	9505	9510	50 %	50 %	0 %	0 %	449068336
173	NC_020247	TGCTT	2	10	9546	9555	0 %	60 %	20 %	20 %	449068337
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175	NC_020247	AAGT	2	8	9634	9641	50 %	25 %	25 %	0 %	449068337
176	NC_020247	ATT	2	6	9672	9677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068337
177	NC_020247	CTC	2	6	9769	9774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068337
178	NC_020247	TAAA	2	8	9781	9788	75 %	25 %	0 %	0 %	449068337
179	NC_020247	ATC	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068337
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182	NC_020247	ACTT	2	8	9862	9869	25 %	50 %	0 %	25 %	449068337
183	NC_020247	TTC	2	6	9889	9894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068337
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254	NC_020247	AAT	2	6	14371	14376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068344
255	NC_020247	AG	3	6	14377	14382	50 %	0 %	50 %	0 %	449068344
256	NC_020247	ATC	2	6	14433	14438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068344
257	NC_020247	ATTTG	2	10	14471	14480	20 %	60 %	20 %	0 %	449068344
258	NC_020247	A	6	6	14493	14498	100 %	0 %	0 %	0 %	449068344
259	NC_020247	TGT	2	6	14535	14540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068344
260	NC_020247	AGA	2	6	14559	14564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068344
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262	NC_020247	AAT	2	6	14601	14606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068344
263	NC_020247	GGA	2	6	14607	14612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068344
264	NC_020247	AGA	2	6	14616	14621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068344
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